Na Área Protegida decorrem duas acções de gestão:
- (1) Gestão activa da Mata da Margaraça;
-(2) Gestão de Habitats invadidos por Acacia dealbata.

1. Gestão activa da Mata da Margaraça
As acções visam diminuir os riscos de incêndios florestais na Mata da Margaraça e contribuir para a renaturalização  das áreas de ecossistema nativo mais afectadas pelo último incêndio e pelo efeito de orla quer junto aos limites da Mata quer junto aos principais acessos.

2. Gestão de Habitats invadidos por Acacia dealbata
Esta acção consiste em  efectuar controlo de continuidade em mancha de acacial em processo de controlo e a eliminação de exemplares isolados de acácia.