Transporte Próprio
A entrada na Reserva Natural do Estuário do Tejo pode ser feita pelas seguintes estradas:
Ponte Vasco da Gama: sentido de Lisboa para Alcochete, saída pelo IC3 nó de Alcochete;
A12: sentido de Setúbal para Lisboa, saída pelo IC3 nó de Alcochete;
A1: sentido Lisboa para Vila Franca de Xira, saídas de Alverca ou Vila Franca de Xira;
EN 10: sentido Vila Franca de Xira para Porto Alto;
EN 118 e EN 119: sentido Porto Alto para Alcochete.
Transportes Públicos
Comboio
Não existe transporte ferroviário para a Reserva. O acesso deverá ser realizado por autocarro, havendo estações da CP nas proximidades para as seguintes localidades: Lisboa (Santa Apolónia ou Gare do Oriente), Vila Franca de Xira e Pinhal Novo.
Autocarro
Lisboa (Santa Apolónia): acesso via fluvial em catamaran Transtejo entre Lisboa (Cais do Sodré) e Montijo (Seixalinho) e depois em autocarro TST para Alcochete;
Lisboa (Gare do Oriente): acesso por autocarro TST entre Lisboa (Gare do Oriente) e Alcochete;
Vila Franca de Xira: acesso por autocarro Ribatejana entre Vila Franca de Xira e Porto Alto;
Pinhal Novo a 17 km da Sede: acesso por autocarro TST entre Pinhal Novo e Alcochete.
A paragem dos autocarros em Alcochete (Igreja Matriz) localiza-se a 100 m da Sede.