O Paul do Boquilobo é uma importante zona húmida que desempenha um papel de grande relevo internacional na conservação de aves aquáticas que aqui encontram condições óptimas para invernada, nidificação ou como suporte às rotas migratórias. 

O paul  apresenta também uma importante função como regulador do sistema hídrico, absorvendo excessos de água no período chuvoso e alimentando os lençóis freáticos no período seco, e como elemento melhorador da qualidade das águas pela comprovada capacidade depuradora.

Alguns dos valores naturais que pode encontrar na Reserva Natural do Paul do Boquilobo encontram-se a seguir descritos.

Geologia, Hidrologia e Clima
Flora
Fauna
Habitats