O interesse biológico da zona nos seus múltiplos aspectos ecológico, botânico, ornitológico e ictiológico; o valor arqueológico do aglomerado de Castro Marim; assim como a alta sensibilidade da área e a sua capacidade influenciadora de factores económicos regionais, designadamente da pesca, da salinicultura e do turismo, foram as razões invocadas no diploma que cria a Reserva.