No PNVG ocorrem três grandes estruturas    geomorfológicas:
-As planícies com ligeira ondulação, e que dominam na área;
-As elevações quartzíticas das serras de Alcaria Ruiva e São Barão;
-Os vales encaixados do rio Guadiana e seus afluentes.

É a presença nessas estruturas de numerosos biótopos – margens e leitos dos cursos de água, matagal mediterrânico, afloramentos rochosos, montados, matos, estepes cerealíferas, pousios e alqueives – que conferem a toda a área do PNVG uma biodiversidade que merece ser preservada.