- Central Nacional de Anilhagem (CEMPA)  

- Monitorização de Aves Aquáticas

- Genética da Conservação

- Veterinária e Saúde Pública

- Cegonha-preta

- Cegonha-branca

- Águia-imperial

- Lobo-ibérico

- Morcegos

- Gato-bravo

- Projectos LIFE Natureza

- Espécies não indígenas

- Novo Atlas das Aves que nidificam em Portugal

- Plano Nacional de Conservação da Herpetofauna e Atlas dos Anfíbios e Répteis de Portugal Continental

- POA - Programa Operacional de Ambiente

- Projectos de cooperação transfronteiriça: Natura Xurés-Gerês e Natura Miño-Minho

- Impacto das linhas eléctricas na avifauna: 

        • Protocolo de colaboração entre o ex-ICN e a Rede Eléctrica Nacional; e

        • Monitorização e minimização dos impactes resultantes da interacção entre as linhas de alta e média tensão e a avifauna (Agosto 2010 actualização com novos documentos)

         • Avaliação do efeito dos parques eólicos sobre os morcegos em Portugal Continental (dados de outubro de 2009)

- INSPECT - (2009 - 2011)
Espécies exóticas marinhas introduzidas em estuários e zonas costeiras portuguesas

- "Intervenção Saramugo 2008"
- "Intervenção Saramugo 2009-2010"
Parque Natural do Vale do Guadiana

- “Plano de Monitorização da Ictiofauna”
Parque Natural do Vale do Guadiana

- Monitorização da população de Águia-real (Aquila chrysaetos) no PNVG - Época de 2010.  Parque Natural do Vale do Guadiana (PNVG). [pdf 1,6 MB]

- Caracterização da População de Águia Real (Aquila chrysaetos) no Parque Natural do Douro Internacional e ZPE do Vale do Côa

- Impacto da Implementação de Medidas de Gestão do Habitat nas Populações de Coelho-bravo no Parque Natural do Sudoeste Alentejano e Costa Vicentina.

- Morcegos e Aves das Florestas de Cantanhez e Cacine (Guiné-Bissau 2007)

- Protecção e Gestão de Abrigos Subterrâneos - Morcegos (EUROBATS)